در یک پست جدید از نوآوری ها و کاربردهای قلب و عروق؛ DOI https: //بیا دیگه.سازمان /1015212 /CVIA20190588، یوكوان چن ، شیائوئی وو ، دانچون هو و وی وانگ ، از دانشكده پزشكی دانشگاه شانتو ، شانتو ، چین و بیمارستان متصل دوم دانشكده پزشكی دانشگاه شانتو ، شانتو ، چین اهمیت ژن های میتوكندری را در كاردیومیوپاتی اتساعی در نظر می گیرند .

نویسندگان این مطالعه را برای شناسایی شبکه های کلیدی بالقوه برای تعامل با پروتئین ها ، ژن ها و مسیرهای همبسته در کاردیومیوپاتی گشاد شده (DCM) با استفاده از روش های بیوانفورماتیک طراحی کردند.

یک مجموعه داده میکروچیپی GSE3586 متشکل از 15 نمونه بیوپسی قلب کاردیومیوپاتیک و 13 نمونه بیوپسی قلب غیرموفق انتخاب شد. در ابتدا ، مجموعه داده های GSE3586 بازیابی و با استفاده از بسته لیمو مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت تا ژنهای متفاوت بیان شود (DEG). در مجموع 172 DEG ، متشکل از 162 ژن بیش از حد تنظیم شده و ده ژن با تنظیم کمتر در DCM ، بر اساس مقادیر اصلاح شده کمتر از 0.01 و تغییر log2 برابر 0.6 یا بیشتر انتخاب شدند.

تجزیه و تحلیل غنی سازی عملکردی هستی شناسی ژن و تجزیه و تحلیل مسیر دائرlopالمعارف کیوتو برای ژن ها و ژنوم ها (KEGG) برای دیدن فرایندهای بیولوژیکی ، اجزای سلولی ، عملکرد مولکولی و مسیرهای KEGG DEG انجام شد. فعل و انفعالات پروتئین و پروتئین ساخته شده و ماژولهای توپی پروتئین شناسایی شدند. سپس ژنهای کلیدی DLD ، UQCRC2 ، DLAT ، SUCLA2 ، ATP5A1 ، PRDX3 ، FH ، SDHD و NDUFV1 انتخاب شدند. آنها در طیف گسترده ای از فعالیت های بیولوژیکی ، مانند چرخه سیترات ، فرآیندهای اکسیداسیون اکسیداسیون ، و تنفس سلولی و تولید انرژی از طریق اکسیداسیون ترکیبات آلی در میتوکندری نقش دارند.

نویسندگان دریافتند که پس از مطالعه فعل و انفعالات پیش بینی شده بین ژن های اصلی و داروها و عوامل رونویسی که درک بهتری از پاتوژنز و مکانیسم های اساسی مولکولی در DCM را فراهم می کنند ، در حال حاضر هیچ داروی مرتبطی برای هدف قرار دادن ژن ها وجود ندارد.

###

اطلاعات استنادی: اهمیت ژن های مرتبط با میتوکندری در کاردیومیوپاتی پیشرفته مبتنی بر بیوانفورماتیک ، Yukuan Chen ، Xiaohui Wu ، Danchun Hu و Wei Wang ، Cardiowax جدید Ap. ، 2020 ، https: //بیا دیگه.سازمان /1015212 /CVIA20190588

کلید واژه ها: کاردیومیوپاتی پیشرفته تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک ژن های متفاوت بیان شده

CVIA در سیستم عامل IngentaConnect و غیره در دسترس است نوآوری ها و کاربردهای قلب و عروق. ارسال مقاله با استفاده از نسخه های خطی ScholarOne انجام می شود. برای ارسال نویسندگان یا پردازش مقالات هزینه ای پرداخت نمی شود. CVIA در پایگاه های اطلاعاتی EMBASE ، ESCI ، OCLC ، Primo Central (Ex Libris) ، Sherpa Romeo ، NISC (شرکت ملی خدمات اطلاعات) ، DOAJ و Index Copernicus نمایه سازی می شود. CVIA را در توییترCVIA_Journal دنبال کنید. یا فیس بوک.

سلب مسئولیت: AAAS و EurekAlert! هیچ مسئولیتی در قبال صحت گزارشهای خبری منتشر شده در EurekAlert ندارند! از طریق موسسات کمک کننده یا استفاده از هرگونه اطلاعات از طریق سیستم EurekAlert.