روش جدید اسکن DNA می تواند منجر به تشخیص سریعتر سرطان و بیماری های نادر شود


درک توالی DNA انسان ، اطلاعاتی در مورد بیماری ها از جمله نحوه تشخیص یا درمان آنها به دانشمندان ارائه می دهد. در مقاله جدید منتشر شده در بیوتکنولوژی طبیعی، دانشمندان دانشکده علوم زندگی دانشگاه نشان داده اند که اکنون می توان قطعات DNA را سریعتر و با صرفه تر از قبل توالی یابی کرد ، بدون اینکه به دنبال رشته های DNA باشد که با موضوع بیولوژیکی ارتباط ندارند ، رسیدن به این پاسخ سریعتر از قبل.

این می تواند پیامدهای عمده ای در درک بیماری های ژنتیکی داشته باشد.

پروفسور مت لاو از مرکز تعیین توالی DeepSeq در دانشکده علوم زندگی دانشگاه هدایت این پروژه را بر عهده دارد. وی گفت: “به عبارت ساده ، اکنون می توانیم بیت DNA موردنظر خود را توالی یابی كنیم و بیتی را كه نمی پذیریم نادیده بگیریم. پیشرفت های ارائه شده در اینجا به این معنی است كه می توانیم مناطق ژنوم حتی به اندازه ژنوم انسانی را جستجو و توالی یابی كنیم. “

مطالعه جدید نشان می دهد که چگونه تیم می تواند به سرعت ژنوم های انسانی را اسکن کرده و ناهنجاری های ژنتیکی را در MinION ، یک ترتیب سنج قابل حمل DNA شناسایی کند. آنها این موضوع را با محلی سازی تغییر در DNA مسئول نوع خاصی از سرطان در کمتر از 15 ساعت نشان می دهند. ژنوم انسان دارای 3 میلیارد نقطه داده است و تجزیه و تحلیل معمول کل ژنوم ممکن است چندین روز طول بکشد. به این ترتیب ، تیم نشان داد که این روش اکنون می تواند برای “اسکن” ژنوم های پرسرعت مورد استفاده قرار گیرد تا بدون وجود توالی برای تعیین ژنومهای کامل یا انجام فرآیندهای آزمایشگاهی پیچیده ، مشکلات آشکاری وجود داشته باشد. برای انتخاب مناطق مورد علاقه ژنومی.

این تیم یک روش انتخابی جدید به نام ReadFish را ایجاد کرده اند که به ترتیب سنج DNA اجازه می دهد فقط آن مناطق از ژنوم انسانی (یا هر ژنوم) مورد علاقه برای یک مسئله خاص را انتخاب کند و بنابراین فقط به استفاده از یک چرخه توالی نیاز دارد.

پروفسور لووز ادامه می دهد: “این دستیابی به موفقیت به ما اجازه می دهد تا تعدادی از برنامه های کاربردی مانند جستجوی سریع قطعات ژنوم انسانی را بررسی کنیم تا شواهدی از شرایط ژنتیکی یا تغییراتی را که می تواند منجر به بیماری مانند سرطان شود – کنیم که بسیار عالی خواهد بود. عواقب تشخیص

“ما در حال حاضر شاهد هستیم که افرادی برای اولین بار از این روش برای شناسایی دلایل اصلی بیماری در افراد مختلف استفاده می کنند *.”

الكساندر پین ، نویسنده اصلی این تحقیق ، می گوید: “داشتن یك توالی واقعاً تطبیقی ​​كه می تواند با پیشرفت آزمایش پاسخ دهد ، فرصتهای هیجان انگیزی را برای سفارشی سازی و شخصی سازی توالی شما برای موضوع مورد نظر فراهم می كند. من واقعاً هیجان زده ام كه ​​می بینم چگونه از ReadFish استفاده می شود. از جامعه نانو منافذ. ”

گوردون سانگرا ، مدیر عامل آکسفورد نانوپور ، تولیدکنندگان فناوری تعیین توالی در زمان واقعی که این کار بر روی آن انجام شده است ، گفت که “الكساندر پین ، مت لوو و تیم از فن آوری توالی زمان واقعی بهره مند شده اند تا برای افزایش هوشمندانه مناطق مورد علاقه در ژنوم ضروری انسان. تأثیر بالقوه این کار می تواند در ارائه پاسخ سریعتر به دستگاههایی که کوچک ، ارزان و آسان برای استفاده هستند ، عمیق باشد. این مطالعه کاملاً هدف ما را برای امکان تجزیه و تحلیل هر موجود زنده توسط هر کسی ، در هر کجا نشان می دهد. ”

آخرین مطالعه به دنبال مطالعه قبلی منتشر شده توسط این تیم در سال 2016 انجام شد ، جایی که آنها در ابتدا روش جدیدی برای تعیین توالی بسیار انتخابی را نشان دادند. این روش از توالی نانو حفره ها در زمان واقعی استفاده می کند و برای اولین بار به انسان اجازه می دهد فقط رشته های DNA را که حاوی امضای از پیش تعریف شده مورد علاقه هستند ، تجزیه و تحلیل کند.

در سال 2018 ، همان تیم یک کنسرسیوم بین المللی را برای تعیین توالی کل ژنوم انسانی ترتیب سنج DNA قابل حمل جیبی دستی MINION به اندازه Oxford Nanopore Technologies هدایت کرد. در آن زمان ، این به بیش از 40 توالی جداگانه از ترتیب سنج قابل حمل نیاز داشت. از آن زمان این فناوری از نظر مادی پیشرفت کرده است.

###

(https: //www.بیورکسیوسازمان /محتوا /101101 /20201103365395v1)

سلب مسئولیت: AAAS و EurekAlert! هیچ مسئولیتی در قبال صحت گزارشهای خبری منتشر شده در EurekAlert ندارند! از طریق موسسات کمک کننده یا استفاده از هرگونه اطلاعات از طریق سیستم EurekAlert.


منبع: kolah-news.ir

دسته‌بندی نشده

دیدگاهتان را بنویسید

Comment
Name*
Mail*
Website*